Melike Lakadamyali Icforex

Melike Lakadamyali, Ph. D. O grupo avançado de imagem e biofísica de fluorescência, ICFO-Institute of Photonic Sciences 1. Por favor, conte-nos sobre sua pesquisa. Minha pesquisa está focada no estudo de uma questão central na biologia celular: como a organização das proteínas no espaço e no tempo afeta a função celular. Eu estudo esta questão central no contexto de uma série de diferentes problemas biológicos que vão desde o transporte intracelular, organização da cromatina organização sináptica. Em todos esses casos, eu uso a microscopia de fluorescência de super resolução e outros métodos baseados em uma única molécula, como o rastreamento de uma única partícula, juntamente com uma análise quantitativa, para extrair informações sobre a dinâmica, estequiometria e organização de complexos multi-proteína e relacionar essa informação com Sua função na célula. Em geral, me esforço para abordar questões fundamentais em biologia, que também têm implicações para a saúde e doenças. 2. Quais aplicativos você usa os sistemas Nikon N-STORM para eu estou usando o sistema Nikon N-STORM principalmente para imagens de super-resolução. Em particular, nos últimos anos, em colaboração com Maria Pia Cosma, no Centro de Regulação Genómica (CRG) de Barcelona, ​​temos vindo a imaginar a organização dos nucleossomas dentro do núcleo de vários tipos de células utilizando a N-STORM sistema. Esses estudos nos permitiram obter novos conhecimentos sobre a forma como a cromatina é organizada nas escalas de comprimento do nanômetro e encontrar e importante elo entre essa organização e o estado celular. Descobrimos que os nucleossomos são organizados em grupos, que chamamos de embreagens de nucleosomas não podem ser visualizados com o microscópio convencional. O tamanho das garras de nucleossomos é específico da célula e correlaciona-se com a pluripotência. Publicamos tudo isso no papel Cell. Imagem convencional de fluorescência (superior) e super-resolução (menor) da proteína histona H2B dentro de um núcleo de fibroblasto. Veja Ricci, M. A. Manzo, C. Garcia-Parajo, M. F. Lakadamyali, M. Cosma, M. P. Cell, 2015 para mais detalhes. 3. O que você valoriza sobre este sistema Nikon A melhor parte do sistema Nikon é o fato de ser amigável. Eu sou um físico, mas meu trabalho é focado em biofísica e trabalho com biólogos regularmente. A maioria dos biólogos não é muito confortável usando microscópios personalizados que ocupam uma tabela óptica inteira e têm muitos componentes manuais que devem ser modificados ou ajustados durante as experiências. Um físico com experiência prática com configurações ópticas pode facilmente usar e manipular essas configurações, mas a maioria dos biólogos está à procura de sistemas fáceis de usar, que são robustos e confiáveis. O sistema Nikon torna muito mais fácil para mim colaborar com biólogos. 4. Quais são as demandas futuras de microscópios e imagens. A microscopia de luz sofreu uma revolução na última década. Nós vimos que é possível superar uma das limitações fundamentais na física, o limite de difracção, usando truques inteligentes com os fluorescentes dentro e fora dos estados de fluoróforos. Isso realmente abriu novas portas para a compreensão da biologia nas menores escalas de comprimento. Eu acredito que o futuro imediato verá uma explosão de novas descobertas em biologia, pois esses métodos passarão de uma ferramenta de especialistas para o uso diário. No entanto, ainda precisamos resolver grandes desafios, principalmente a capacidade de imagens profundas dentro de amostras grossas, a capacidade de imagem de processos dinâmicos rápidos em células vivas com resolução espacial em nanoescala e a capacidade de extrair informações quantitativas significativas das imagens de super resolução. À medida que impulsionamos as aplicações biológicas de métodos de super-resolução, teremos de superar esses desafios e as demandas futuras estarão principalmente nesses tópicos. Investigador Entrevistas Solicitar informações FacebookAdvanced Fluorescence Imaging e Biofísica Prof. Dr. Melike Lakadamyali O grupo Advanced Fluorescence Imaging e Biofísica é um grupo interdisciplinar que trabalha na interface de técnicas avançadas de microscopia de luz e suas aplicações biológicas. Estamos interessados ​​em desenvolver técnicas de imagem de fluorescência com alta resolução espaciotemporal e usar essas técnicas para estudar questões em virologia, neurociências e outros campos. Nosso objetivo é elucidar questões biológicas fundamentais que também têm implicações importantes para a saúde. Somos um grupo recentemente estabelecido (data de início de setembro de 2010) e esperamos crescer rapidamente em uma equipe de pesquisa multidisciplinar de físicos, engenheiros e biólogos. Contato: Este endereço de e-mail está protegido contra spambots. Você deve habilitar o JavaScript para visualizá-lo. Fluorescência Avançada e Biofísica Prof. Dr. Melike Lakadamyali Fluorescência Avançada e Biofísica Prof. Dr. Melike Lakadamyali Papéis Regulares As superfícies funcionalizadas com molhabilidade adaptada determinam a infecciosidade da influenza I. Mannelli, R. Reigada, I. Surez, D. Janner, A Carrilero, P. Mazumder, F. Sagus, V. Pruneri, M. Lakadamyali ACS Appl. Mater. Interfaces 8. 15058-15066 (2016) O citoesqueleto de actina modula a activação de células iNKT segregando os nanoclusters CD1d nas células apresentadoras de antigénio JA Torreno-Pina, C. Manzo, M. Salio, MC Aichingerb, A. Oddone, M. Lakadamyalia, D. Shepherd, GS Besra, V. Cerundolo MF Garcia-Parajo P. Natl. Acad. Sei. EUA 113. E772E781 (2016) As fibras de cromatina são formadas por grupos heterogéneos de nucleosomas in vivo M. A. Ricci, C. Manzo, F. Garca-Parajo, M. Lakadamyali, M. P. Cosma Cell 160. 1145-1158 (2015) Os anticorpos do receptor N-metil-D-aspartato humano alteram a memória e o comportamento em camundongos J. Planagum, F. Leypoldt, F. Mannara, J. Gutirrez - Cuesta, E. Martn-Garca, E. Aguilar, MJ Titulaer, M. Petit-Pedrol, A. Jain, R. Balice-Gordon, M. Lakadamyali, F. Graus, R. Maldonado, J. Dalmau Brain 138. 94-109 (2015) Cover Page Cross-talk-free sem formatação de imagem STORM usando um único fluoróforo J. Tam, G. A. Cordier, J. S. Borbely,. Sandoval lvarez, M. Lakadamyali PLoS ONE 9. E111878 (2014) Microscopia quantitativa de super resolução: armadilhas e estratégias para análise de imagens N. Durisic, L. Laparra Cuervo, M. Lakadamyali Curr. Opin. Chem. Biol. 20. 22-28 (2014) Microscopia de super resolução: indo ao vivo e indo rápido M. Lakadamyali ChemPhysChem 15. 630-636 (2014) Navegando na célula: como os motores superam barreiras e engarrafamentos para transporte eficiente de carga M. Lakadamyali Phys. Chem. Chem. Phys. 16. 5907-5916 (2014) Imagem de super-resolução com localização estocástica de uma única molécula: Conceitos, desenvolvimentos técnicos e aplicações biológicas A. Oddone, I. Verdeny Vilanova, J. Tam, M. Lakadamyali Microsc. Res. Techniq. 77. 502-509 (2014) Avaliação de uma única molécula da eficiência de fotoativação de proteínas fluorescentes usando uma nanotemplaca in vivo N. Durisic, L. Laparra-Cuervo, A. Sandoval-lvarez, J. S. Borbely, M. Lakadamyali Nature Methods 11. 156-162 (2014) Relatório de reunião Visualizando nanoplataformas de sinalização em uma resolução espaciotemporal mais elevada A. Cambi, M. Lakadamyali, D. S. Lidke, M. F. Garcia-Parajo J. Cell Sci. 126. 3817-3821 (2013) Correlativo live-cell e superresolução microscopia revela dinâmica de transporte de carga em cruzamentos de microtúbulos. Blint, I. Verdeny Vilanova,. Sandoval lvarez, M. Lakadamyali P. Natl. Acad. Sei. EUA 110. 3375-3380 (2013) Página de rosto GraspJ: um pacote de análise de código aberto, em tempo real para imagens de super-resolução N. Brede, M. Lakadamyali Opt. Nanosc. 1. 11 (2012) Imagens de alta resolução da conectividade neuronal M. Lakadamyali J. Microsc. 248. Esteichiometria do receptor de glicina humana revelada por contagem de subunidades diretas N. Durisic, A. G. Godin, C. M. Wever, C. D. Heyes, M. Lakadamyali, J. A. Dent J. Neurosci. 32. 12915-12920 (2012) 3D multicolor super-resolução de imagens oferece maior precisão no rastreamento neurônico M. Lakadamyali, H. Babcock, M. Bates, X. Zhuang, J. Lichtman PLoS ONE 7. E30826 (2012) Proceedings Capítulos de livros Imaging estrutura celular através de escalas com luz correlacionada, superresolução e microscopia eletrônica J. A. G. Briggs, M. Lakadamyali Mol. Biol. Célula. 23. (1) Microscopia de super resolução e suas aplicações biológicas M. Lakadamyali CNIO, Universidade de Heidelberg, Alemanha (2012) Microscopia de super resolução e suas aplicações biológicas M. Lakadamyali CNIO, Madrid, Espanha (2012) Microscopia super-resolução e suas aplicações biológicas M. Lakadamyali Karolinska Institute, Estocolmo, Suécia (2012) Probing transporte de carga com células vivas correlacionadas e microscopia super-resolução M. Lakadamyali European Microscopy Congress, ) Probing transporte de carga com células vivas correlacionadas e microscopia super-resolução M. Lakadamyali Simulador de microscopia de localização única suíça molecular, Lausanne, Suíça (2012) Imagem de super resolução e suas aplicações para a biologia M. Lakadamyali IMPPC, Barcelona, ​​Espanha (2012) Capturing Lifes processos com luz M. Lakadamyali TEDxBarcelona Ciência, Barcelona, ​​Espanha (2011) Super-resolução microscopia M. Lakadam (2011) Capturando lifes processos com luz M. Lakadamyali TEDxBarcelona Ciência, Barcelona, ​​Espanha (2011) Super-resolução de imagens e suas aplicações para Biologia M. Lakadamyali Workshop em Super-resolução e 4D Confocal Imaging, Umea, Suécia (2011) Imagem de super resolução e suas aplicações para a biologia M. Lakadamyali De Microscopia Quantitativa a Modelos Biofísicos, Corse Prático em Microscopia de Luz Avançada, Bayreuth, Alemanha 2011) Imaging conectividade neuronal em alta resolução M. Lakadamyali Desenvolvimento de circuitos neurais e plasticidade: progresso feito e promessas à frente, Academia Colóquio, Amsterdam, Holanda (2011) Imaging conectividade neuronal em alta resolução M. Lakadamyali Ver é crer: Imaginando os processos da vida Symposium, Heidelberg, Germany (2011) Mapeamento de conectividade neuronal com microscopia de reconstrução óptica estocástica: The Bra InSTORM M. Lakadamyali Curso avançado em imagens de células vivas, Oslo, Noruega (2010) Estequiometria do receptor de glicina humano revelado por contagem de subunidades diretas N. Durisic, A. G. Godin, C. M. Wever, CD Heyes, M. Lakadamyali, JA Dent, (co-autores), Gordon Research Conference, Single Molécula Abordagens para Biologia, West Dover, VT, EUA (2012) Correlativo viva e super resolução imagem de intracelular transporte S. Balint, N. Brede, A. Sandoval, Reunião da Sociedade Biofísica de M. Lakadamyali, San Diego, EUA (2012) GraspJ: Um pacote de análise de código aberto e em tempo real para imagens de super-resolução N. Brede, M. Lakadamyali Biophysical Society Meeting , San Diego, EUA (2012) Teses de Doutoramento Desvendando a dinâmica de transporte de carga 3D na rede de microtúbulos com microscopia super-resolução I. Verdeny Vilanova Advanced Fluorescência Imaging e Biofísica Prof. Dr. Melike Lakadamyali 2016-10-14 Parabéns ao novo ICFO PhD Dr. Ione Verdeny Vilanova formou-se com uma tese em Unraveling 3D dinâmica de transporte de carga na rede de microtúbulos com microscopia super-resolução 2016-07-20 Funcionalidade superfícies de molhabilidade adaptados e Influenza A Infectivity Findings pa O caminho para a concepção de novas superfícies antimicrobianas. 2016-05-25 ICREA Symposium Internacional BioNanoVision de arquitetura celular 2016-03-21 BIONANO ICFO ICFO está estabelecendo um ritmo acelerado no avanço da pesquisa BioNano 2016-03-21 Vozes da Biotecnologia Melike Lakadamyali participa na Nature Biotechnologys especial 20o Aniversário edição 2016 -01-25 Imunoterapia contra o câncer a partir da nanoescala Um novo mecanismo para regular a ativação de células T Natural Killer no PNAS Plus 2015-09-02 ICREA ICREA Prêmio ICREA Prof Maria Garcia-Parajo e Prof Melike Lakadamyali para sediar 2016 ICREA Conference at ICFO on Super - Resolução Microscopia 2015-03-12 ICFO em células Super-resolução microscópios revelam a ligação entre Genome Packaging e Pluripotência Celular 2015-01-07 Avanços na perda de memória Um estudo publicado na revista Brain relatórios sobre os avanços na memória e deficiências comportamentais 2014- 03-12 Regras de trânsito celular Superando bloqueios de tráfego celular e engarrafamentos em Físico-Química Física Química 2014-01-07 Medição de Eficiência de Photoativação No nível de molécula única ICFOs Grupo avançado de imagem de fluorescência e biofísica em Nature Methods. 2013-11-06 Programa de Investigadores Jovens da EMBO Prof. Melike Lakadamyali, beneficiário do prestigiado Subsídio do Programa Jovem Investigador da EMBO. 2013-07-22 ERC Prêmio de Premiação concedido ao Prof. Melike Lakadamyali A bolsa apoia jovens pesquisadores para se estabelecer como líderes de pesquisa independentes. 2013-02-13 ICFO na capa dos pesquisadores PNAS informam sobre o novo método de imagem totalmente ótica combinando microscopia de super resolução com rastreamento de partículas únicas. 2012-12-13 ICFO no Consórcio de Microscopia de Sistemas O grupo liderado pelo Prof. Melike Lakadamyali junta-se a uma rede de imagens de células vivas de excelência. 2012-07-03 Workshop STORM na ICFO Oficina de co-patrocinadores da Nikon sobre tecnologia STORM 2012-02-01 TEDxBarcelona-Ciência Melike Lakadamyali explica como a tecnologia STORM pode capturar processos de vida na TEDxBarcelona-Science. 2011-06-01 Workshop STORM no ICFO Nikon Europe organiza workshop após a inauguração do STORM Centro de Excelência no ICFO 2011-05-31 Nikon Centro de Excelência em STORM no ICFO A parceria permitirá aos pesquisadores acesso a state-of-the-art super Sistemas de resolução. 2010-11-17 Prêmio Científico Húngaro Dr. Stefan Balint, ex-doutorando do grupo liderado pelo Prof. Dmitri Petrov, premiado pela Academia Húngara de Ciências.